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Plateau bio-informatique

Au cœur du Campus du plateau de Saclay, l’Institut des IPS2,  est fortement impliqué dans la biologie intégrative végétale (NextGen Sequencing, épigénomique, imagerie, métabolomique). Plusieurs équipes de recherche développent des projets en génomique des plantes (Équipes M. Benhamed, C. Lurin, M-L. Martin-Magnette, M. Crespi, A. Bendahmane).

Baie

En 2017 l’IPS2 s’est muni d’un séquenceur NextSeq 500, ceci a significativement augmenté la quantité de données à traiter dans l’institut.  Le « Plateau Bio-informatique » vise à répondre au « data déluge » en constituant un pôle ingénieur pour accompagner et soutenir les équipes et les plateformes.

Le Plateau se propose de devenir garant de la qualité et de la reproductibilité des analyses et de proposer des outils et des méthodes pertinentes.

 

 

Les missions du Plateau bio-informatique

  • Analyse de données
  • Développement d’outils
  • Moyens de calcul

 

Membres de l'équipe :

Marion Verdenaud: (marion.verdenaud @ universite-paris-saclay.fr) Ingénieur d'étude, CNRS (Bur. 3.71)

Frédéric Desprez: (frederic.desprez @ universite-paris-saclay.fr) Ingénieur d'étude, CNRS(Bur. 3.71)

Valérie Cantonny: (Valerie.Cantonny @ ips2.universite-paris-saclay.fr) Assistante ingénieure, CNRS(Bur. 3.46)