- Présentation
- Recherche
- FunRNA : Conservation fonctionnelle des longs ARN non codants des plantes
- FLOCAD : Développement floral et déterminisme du sexe
- Qlab : Equipe Génomique et épigenomique quantitative des plantes
- ChromD : Dynamique des chromosomes
- SILAB : Voies de signalisation régulant l'architecture du système racinaire des légumineuses en réponse à des bactéries bénéfiques
- CCARS : Changement climatique et signalisation redox
- STRESS : Voies de signalisation du stress
- OGE : Expression des génomes des organites
- Modélisation mathématique et informatique pour les études plant-omics COMPAS / Marie-Hélène Mucchielli-Giorgi & Guillem Rigaill
- GUILLOTIN Lab
- Enseignement
- Plateformes
- Bases de données
Plateau bio-informatique
Au cœur du Campus du plateau de Saclay, l’Institut des IPS2, est fortement impliqué dans la biologie intégrative végétale (NextGen Sequencing, épigénomique, imagerie, métabolomique). Plusieurs équipes de recherche développent des projets en génomique des plantes (Équipes M. Benhamed, C. Lurin, M-L. Martin-Magnette, M. Crespi, A. Bendahmane).
En 2017 l’IPS2 s’est muni d’un séquenceur NextSeq 500, ceci a significativement augmenté la quantité de données à traiter dans l’institut. Le « Plateau Bio-informatique » vise à répondre au « data déluge » en constituant un pôle ingénieur pour accompagner et soutenir les équipes et les plateformes.
Le Plateau se propose de devenir garant de la qualité et de la reproductibilité des analyses et de proposer des outils et des méthodes pertinentes.
Les missions du Plateau bio-informatique
- Analyse de données
- Développement d’outils
- Moyens de calcul
Membres de l'équipe :
Marion Verdenaud: Ingénieur d'étude, CNRS (Bur. 3.71)
Frédéric Desprez: Ingénieur d'étude, CNRS(Bur. 3.71)
Valérie Cantonny: Assistante ingénieure, CNRS(Bur. 3.46)