Le long ARN non-codant ARES module l’architecture racinaire d’Arabidopsis via la réponse à l’auxine

Les plantes doivent s’adapter à des conditions environnementales changeantes pour survivre et se reproduire. Elles y parviennent notamment en ajustant leur architecture racinaire (nombre et longueur des racines), optimisant ainsi l’absorption de l’eau et des nutriments. Ce processus est contrôlé par un réseau de gènes. Les longs ARN non codants (lncRNAs) régulent l’expression d’autres gènes, dont certains sont impliqués dans le contrôle de l’architecture des racines.

Dans une étude publiée dans IUBMB Life, des chercheurs de l’IPS2 (équipe REGARN) avec leurs collaborateurs de l’ « Instituto de Agrobiotecnología del Litoral en Argentine » (équipe EpiLab) ont identifié le lncRNA ARES (« AUXIN REGULATOR ELEMENT DOWNSTREAM SOLITARY ROOT ») situé en aval du régulateur principal des racines latérales « SOLITARY ROOT » (SLR). Même si ARES et SLR sont corégulés au cours du développement des racines et en réponse à l’auxine, les altérations d’ARES n’affectent pas l’expression de SLR. En revanche, elles affectent l’expression de son autre gène voisin NF-YB3 dont l’impact sur le développement des racines n’est pas connu, ainsi que l’expression et l’épissage d’un sous-ensemble de gènes importants pour le développement du système racinaire. En accord avec ce résultat, la dérégulation d’ARES provoque un phénotype de développement des racines latérales. Le lncRNA ARES apparaît comme un nouveau régulateur du développement des racines latérales dépendant de l’auxine, agissant probablement en modulant l’expression de gènes liés aux racines latérales qui restent à découvrir.

En haut : La diminution de l’expression du long ARN non-codant ARES ne modifie pas de manière significative l’expression des gènes voisins. En bas : La diminution de l’expression d’ARES diminue la longueur moyenne des racines latérales (droite) sans affecter la longueur de la racine principale (gauche) ou la densité de racines latérales (milieu).

24/11/2023