Quelques exemples d’applications

Analyses métabolomiques avec la technique de chromatographie gazeuse couplée à la spectrométie de masse (GC-MS)

Collaboration avec B. Hirel – IJPB. Identification d'un certain nombre de métabolites du maïs représentatifs de l'interaction plante-bactérie et spécifiques des souches, qui ont une activité fonctionnelle nitrogenase. (Liziane Cristina Brusamarello-Santos, Françoise Gilard, Lenaïg Brulé, Isabelle Quilleré, Benjamin Gourion, Pascal Ratet, Emanuel Maltempi de Souza, Peter J. Lea, Bertrand Hirel : Metabolic profiling of two maize (Zea mays L.) inbred lines inoculated with the nitrogen fixing plant-interacting bacteria Herbaspirillum seropedicae and Azospirillum brasilense. PLoS ONE 03/2017 ; 12(3)., DOI:10.1371/journal.pone.0174576).

 

Métabolites dans les racines et les feuilles des plants de maïs inoculés avec les souches Fix + et Fix- de A. brasilense et H. Sepodedicae et les plantes non inoculées.

 

Analyses isotopiques avec la technique d’analyse élémentaire couplée à la spectrométrie de masse à ratio isotopique (EA-IRMS)

Collaboration with Arvalis for the project FSOV 2012 K. Identification de traits de tolérance à la sécheresse et élaboration d’outils d'aide à leur évaluation (Jean-Charles DESWARTE, Katia BEAUCHENE, Eric OBER, Thierry MOITTIE, Camille BEDARD,Laure DUCHALAIS, Jérémy DERORY, Céline ZIMMERLI, Valérie LAURENT, Clément DEBITON, Bertrand GAKIERE, Frédéric BARET ; Colloque FSOV 03/2017.     

 

Relation entre composition isotopique du carbone des grains à la récolte (valeur moyenne mesurée sur 2 variétés témoins) et rendements moyens mesurés dans le réseau d’essais multilocal.	Histogramme illustrant la variabilité génétique (moyenne ajustée) du 13C dans le réseau d’essais multilocal. Les barres d’erreur indiquent l’erreur standard. Les barres de couleur repèrent les 2 témoins Apache (bleu) et Bermude (rouge).

 

Analyses fluxomiques avec la technique de résonance magnétique nucléaire (RMN)

Project SPS2020 PISTILL and pHD Camille Chalvin  (collaboration with M. Dron  and A. Boulaem –IPS2). The objective is to dissect the synthesis pathway of a terpenoid obtained from a lamiaceae and which has a strong interest for aromatic industry. Isotopic molecules feeding experiments, analysis by mass spectrometry and fluxomics are used to identify the various intermediate molecules and the metabolic fluxes of the pathway.

 

 

Analyses de co-facteurs avec la technique de chromatographie liquide ultra haute performance couplée à la spectrométie de masse (LC-MS)

Métabolisme du NAD. Florence Guérard, Pierre Pétriacq, Bertrand Gakière, Guillaume Tcherkez : Chromatographie liquide/Spectrométrie de masse à temps de vol pour l'analyse d'échantillons de plante : une méthode pour une sélection simultanée de co-facteurs communs ou nucléotides et application à une lignée de plante modifiée. Plant Physiology and Biochemistry, volume 49, Issue 10, October 2011, p1117-1125.

 

Résumé de la performance LCeTOF pour l’analyse de metabolites choisis.	Contenu de feuilles dans les métabolites  impliqués dans la biosynthèse NAD dans les lignées type sauvage et nadC.

 

 

La voie métabolique a été examinée ici, qui inclut la biosyntèse du dinucleotide nicotinamine (NAD). La lignée Arabidopsis modifiée examinée dans l'étude présente (nadc) exprime le codage de gène pour quinolinate bactérien phosphoribosyl transférase (QPRT, EC 2.4.2.19), indiqué avec une étoile. D'autres enzymes sont indiquées par leur numéro EC.