- Présentation
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- FunRNA : Conservation fonctionnelle des longs ARN non codants des plantes
- FLOCAD : Développement floral et déterminisme du sexe
- Qlab : Equipe Génomique et épigenomique quantitative des plantes
- ChromD : Dynamique des chromosomes
- SILAB : Voies de signalisation régulant l'architecture du système racinaire des légumineuses en réponse à des bactéries bénéfiques
- CCARS : Changement climatique et signalisation redox
- STRESS : Voies de signalisation du stress
- OGE : Expression des génomes des organites
- COMPAS : Modélisation mathématique et informatique pour les études plant-omics
- GDYNPATH : Dynamique du génome et résistance aux agents pathogènes
- Analyse à l'échelle du génome des gènes NL dans le génome du haricot commun
- Développement et mise en œuvre de VIGS pour le haricot commun et le pois à l'aide du BPMV
- Résistance des plantes dans le contexte du changement climatique et de l'agriculture biologique
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POPS: La plateforme transcriptomique
Concevoir en amont pour analyser en aval
La Plateforme transcriptOmique de Paris Saclay, POPS propose un panel de prestations techniques et bio-informatiques pour l’analyse du transcriptome des plantes. Nous sommes situés au 630 avenue des sciences à Gif-Sur Yvette et sommes ouverts du lundi au vendredi entre 9h30 et 17h00.
L’accès au séquençage RNA-Seq pour des projets d’analyse du transcriptome est possible dans le cadre de collaborations entre POPS et d’autres laboratoires, dans la mesure des ressources produites à l’IPS2.
Vous pouvez nous contacter soit par mail aux adresses suivantes pops.ip2 @ inrae.fr ou pops.ips2 @ universite-paris-saclay.fr soit par téléphone au 01.69.15.77.67.
La Plateforme transcriptOmique de Paris Saclay, POPS, localisée à Gif sur Yvette (91), a été créée en 2003 et a pour mission principale de proposer un panel de prestations techniques et bio-informatiques pour l’analyse du transcriptome des plantes. C’est le « service intégré à façon ».
POPS permet à une communauté scientifique publique ou privée de répondre à des questions biologiques grâce au séquençage à haut débit des ARNs couramment nommé le RNA-Seq. Nous réalisons des projets d’étude en collaboration avec des équipes de recherche nationales et internationales. Nous avons fait le choix de nous spécialiser exclusivement sur les végétaux afin d’avoir une expertise forte et de conseiller au mieux nos collaborateurs sur leurs projets. A ce jour, nous avons travaillé sur plus de 93 espèces différentes.
Notre champ d’application implique de rester à la pointe de la technologie dans le domaine du séquençage et de l’analyse des données afin de proposer des protocoles techniques et des analyses bioinformatiques les plus pertinents et intéressants tant sur le plan biologique que financier, notre seconde mission est le « développement ».
Enfin transmettre le savoir acquis grâce à la communauté est important. La plateforme dispense des formations, participe à des enseignements, coorganise les « journées omiques végétales » et accueille des stagiaires. C’est un aspect essentiel nommé « Formation & animation scientifique ».
