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- DGG : Département Génomique et Génétique du Développement
- REGARN : Les ARN non-codants, des acteurs de la plasticité développementale de la racine
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- SILEG : Voies de signalisation contrôlant le développement du système racinaire des légumineuses
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- Qlab : Equipe Génomique et épigenomique quantitative des plantes
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- DGG : Département Génomique et Génétique du Développement
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Les organites au cœur des réponses au stress
Les plastes sont le siège de la photosynthèse et de diverses réactions métaboliques, notamment le métabolisme des acides aminés, des lipides, de l'amidon et du soufre, qui sont tous fortement affectés par les variations environnementales. En outre, plusieurs agents pathogènes ciblent les plastes avec des effecteurs dans le cadre de leur stratégie de virulence et les plastes participent à la synthèse de phyto-hormones clés impliquées dans les interactions entre les plantes et les agents pathogènes. Ils sont également une source majeure d'espèces réactives de l'oxygène impliquées dans les immunités déclenchées par les pathogènes et les effecteurs. Ainsi, étant au cœur de la photosynthèse et du métabolisme primaire, les plastes intègrent, décodent et répondent aux signaux cellulaires et environnementaux, y compris les stress biotiques et abiotiques. Nos résultats indiquent également un rôle majeur des chloroplastes dans la réponse au stress. En utilisant notre plateforme SPOMics-InterATOME, nous avons identifié que plusieurs protéines localisées dans les plastes sont ciblées par des effecteurs pathogènes fongiques et bactériens et qu'une seule protéine cytoplasmique liée au stress interagit avec toutes les protéines encodées dans les plastes. En outre, le réseau de gènes de résilience au stress d'Arabidopsis que nous avons identifié grâce à une méta-analyse, en étroite collaboration avec l'équipe des Réseaux génomiques, des données produites par la plateforme POPS confirme l'importance de l'expression des gènes du plaste dans la réponse au stress. Une analyse détaillée de ces réseaux fournit un certain nombre de candidats intéressants que nous sommes en train de caractériser.
Figure : les plates au cœur des réponses au stress. A : le réseau de résilience au stress d'Arabidopsis thaliana contient de nombreux groupes de gènes associés à des fonctions du plaste (en vert). B : Les protéines encodées dans les plastes (points verts) interagissent en double hybride de levure avec plusieurs protéines de défense (points orange) et liées au RE (points jaunes), dont une protéine liée au RE qui interagit avec l'ensemble de ces protéines (flèche rouge). C : Plusieurs effecteurs pathogènes (points violets) interagissent avec des protéines ciblées sur les plastes (points verts).