Program

Lundi 14 octobre

  • 10h00-10h15 : Accueil
  • 10h15-10h30 : Introduction (Marie-Laure Martin-Magniette)
  • 10h30-11h30 : Olivier Gandrillon (LBMC, Lyon) / Arnaud Bonnaffoux (Société Vidium, Lyon) Inferring mechanistic gene regulatory networks from single cell data diaporama
  • 11h30-12h30 : Mikael Lucas (DiADE, Montpellier) / Kevin Bellande (DiADE, Montpellier) Dynamics of Gene Regulatory Network Governing de novo Lateral Root Primordium Development diaporama

12h30-14h00 : Repas offert par NETBIO

  • 14h00-15h00 : Etienne Delannoy (IPS2, Gif-Sur-Yvette) / Pierre Latouche (Université de Paris, Paris) Identification de modules fonctionnelles par l’analyse topologique d’un reseau de corégulation diaporama
  • 15h00-16h00 : Mathieu Thomas (AGAP, Montpellier) / Pierre Barbillon (MIA-Paris, Paris) Influence des réseaux de circulation de semences sur l'évolution de la diversité génétique des espèces cultivées diaporama
  • 16h00-16h30 : Pause
  • 16h30-17h30 : Laurence Liaubet (GenPhySE, Toulouse) / Nathalie Vialaneix (MIA-T, Toulouse) Combining co-expression and co-location for gene network inference in porcine muscle development in late gestation diaporama

Mardi 15 octobre

  • 08h45-09h00 : Accueil
  • 09h00-10h30 : Sophie Donnet (MIA-Paris, Paris) Introduction aux réseaux bi-partites diaporama
  • 10h30-11h00 : Pause
  • 11h00-12h00 : Engelbert Mephu Nguifo (LIMOS, Clermont Ferrand) A novel computational approach for global alignment of multiple biological networks diaporama

12h00-14h00 : Repas offert par NETBIO

  • 14h00-15h00 : Julie Aubert (MIA-Paris, Paris) Latent block model for overdispersed count data. Application in microbial ecology diaporama
  • 15h00-15h30 : Clémence Karmann (IECL/INRIA, Nancy) Méthode des knockoffs revisités pour la sélection de variables. Application à l'inférence de réseaux pour modèles inflatés en zéro diaporama
  • 15h30-16h00 : Pause
  • 16h00-16h30 : Martina Sundqvist (MIA-Paris, Orsay) Cluster stability for class dicovery: when and how to use it? diaporama
  • 16h30-17h00 : Audrey Hulot (GABI, Jouy-en-Josas) Fast tree aggregation for consensus hierarchical clustering diaporama

Mercredi 16 octobre

  • 09h30-10h30 : Vincent Fromion (MaIAGE, Jouy-en-Josas) La modélisation systémique de la cellule constitue-t-elle une base utile de la représentation des liens entre les entités de la cellule à travers des « graphes » ?
  • 10h30-11h00 : Léa Boyrie (LRSV, Toulouse) Towards a network approach to detect genome-wide signature of gene coadaptation using SNP data diaporama
  • 11h00-11h30 : Pause
  • 11h30-12h30 : Actualités NETBIO

12h30-14h00 : Repas offert par NETBIO

  • 14h00-14h30 : Stéphane Robin (MIA-Paris, Paris) Analyse topologique d’un réseau inféré diaporama
  • 14h30-15h00 : Christophe Giraud (LMO, Orsay) Forces et faiblesses du mean-field varational bayes inférence
  • 15h00-15h30 : Perrine Lacroix (IPS2/LMO, Orsay) Comparaison de méthodes d’inférence de graphe diaporama
  • 15h30-16h00 : Michael Pierrelee (IBDM, Marseille) TimeNexus identifies dynamic pathways from gene expression time-series using temporal networks diaporama
  • 16h00-16h15 : Clôture des journées