Modélisation mathématique et informatique pour les études plant-omics COMPAS

Marie-Hélène Mucchielli-Giorgi & Guillem Rigaill

Le projet scientifique de l'équipe COMPAS est d'analyser, modéliser, comprendre et prédire la réponse de plantes modèles ou d'intérêt agronomique à des changements environnementaux à partir d'un ou plusieurs types de données infracellulaires ou omiques.

Pour cela, nous développons des approches de biologie numérique, statistiques, machine learning et bioinformatiques rigoureuses.

Nous nous intéressons plus particulièrement à

• l’analyse et l’intégration des données omiques

• l’inférence et l’analyse de réseaux d’interactions protéine-protéine

• la caractérisation des régions promotrices des gènes via la détection des éléments cis-régulateurs