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La methylation pour réguler finement les gènes de résistance
Les gènes de résistance (R) aux maladies constituent un maillon essentiel d’une agriculture durable. Les gènes R de type NB-LRR forment l’une des plus grandes et diversifiées familles multigéniques chez les plantes. Cependant, les gènes R pouvant représenter un coût pour la plante, leur expression doit être finement contrôlée. Malgré leur importance agronomique, ces mécanismes restent mal connus.
Le transcriptome du blé tendre
Le blé est l'une des principales sources de nourriture pour la planète. l'International Wheat Genome Sequencing Consortium a réussi une analyse détaillée du contenu génétique des sous-génomes et de l'organisation structurelle de tous les chromosomes. Moussa Benhamed avec son équipe à l'IPS2 et en collaboration avec le SPS ont participé à cet important projet. Ces ressources sont fondamentales et permettront d’accélérer notre compréhension des mécanismes régulant l’expression des gènes dans cette espèce de grand d’intérêt agronomique.
L’environnement chromatinien des gènes symbiotiques
Les avancées pour déchiffrer l’architecture fonctionnelle des génomes eucaryotes ont été récemment facilitées par les progrès technologiques dans les techniques de séquençage, qui ont permis une représentation plus appropriée non seulement des gènes codants, mais aussi des éléments répétés et des ARN non-codants dans les assemblages de séquences génomiques.
Régulation de l’épissage par des ARN longs non codants
Au cours des dernières années, l'avènement de nouvelles techniques de séquençage a permis d'identifier des milliers d'ARN qui s'expriment tout au long du génome et qui ne semblent pas coder pour les protéines comme le font les ARNm habituels (sauf quelques cas bien caractérisés comme les ARN ribosomaux et de transfert).
Mtnoot1, Mtnoot2 et l'identité des nodosités symbiotiques
Les interactions symbiotiques entre les légumineuses et les rhizobia conduisent à la formation d'un organe symbiotique spécifique appelé nodosités. Dans ce nouveau travail, nous avons identifié et caractérisé le gène MtNODULE ROOT2 (MtNOOT2) et son rôle dans l'identité des nodules.
Les roses: Le génome décrypté
Le rosier... une plante ornementale emblématique de l'histoire de l'humanité.
Son génome a été décrypté avec succès par un consortium international impliquant l'ENS de Lyon, IPS2, l’INRA, le CEA, le CNRS et l’Université Claude Bernard Lyon 1.
Deux équipes de l’IPS2, l’équipe Développement floral et déterminisme du sexe (A. Bendahmane) et l’équipe Cycle cellulaire chromatine et développement (M. Benhamed) ont contribué à ces travaux.La réponse des plantes aux pathogènes implique un remodelage de la chromatine
Les plantes détectent les attaques pathogènes à travers la perception de signaux appelés PAMPs (Pathogen-Associated Molecular Patterns) qui induisent des cascades de signalisation pour activer des facteurs de transcription et des mécanismes de régulation de la structure de la chromatine nécessaires pour l’expression des défenses de la plante
Un complexe de trois protéines PPR au moins est nécessaire à l’édition de dizaines de sites dans les ARN mitochondriaux et chloroplastiques des végétaux supérieurs
Dans un article récemment publié dans la revue PNAS, l’équipe de Claire Lurin à IPS2 révèle qu’un complexe de trois protéines PPR au moins est nécessaire à l’édition de dizaines de sites dans les ARN mitochondriaux et chloroplastiques des végétaux supérieurs.
