- Présentation
- Recherche
- FunRNA : Conservation fonctionnelle des longs ARN non codants des plantes
- FLOCAD : Développement floral et déterminisme du sexe
- Qlab : Equipe Génomique et épigenomique quantitative des plantes
- ChromD : Dynamique des chromosomes
- SILAB : Voies de signalisation régulant l'architecture du système racinaire des légumineuses en réponse à des bactéries bénéfiques
- CCARS : Changement climatique et signalisation redox
- STRESS : Voies de signalisation du stress
- OGE : Expression des génomes des organites
- COMPAS : Modélisation mathématique et informatique pour les études plant-omics
- GNet : Réseaux génomiques
- GDYNPATH : Dynamique du génome et résistance aux agents pathogènes
- Analyse à l'échelle du génome des gènes NL dans le génome du haricot commun
- Développement et mise en œuvre de VIGS pour le haricot commun et le pois à l'aide du BPMV
- Résistance des plantes dans le contexte du changement climatique et de l'agriculture biologique
- Équipe GDYNPATH V. Geffroy
- Publications GDYNPATH V. Geffroy
- Collaborations GDYNPATH V. Geffroy
- GUILLOTIN Lab
- Enseignement
- Plateformes
- Bases de données
Méthodes statistiques pour l'analyse de données omiques
Nous développons des méthodes statistiques pour l'analyse des données moléculaires acquises par des technologies à haut-débit. L'objectif dans le développement de ces méthodes est de tenir compte de la complexité intrinsèque de ce type de données (gestion de la dimension, contrôle des faux-positifs, …) et d'avoir des résultats biologiquement interprétables. Nous sommes experts en classification supervisée ou non-supervisée, les modèles linéaires et leur généralisation ainsi que dans les méthodes algorithmiques. Ces méthodes permettent d'étudier l'activité du génome telle que l'expression des gènes, leurs interactions et les mécanismes de contrôle de l'expression.
Nos sujets de recherche actuels sont :
- Les études de comparaisons neutres.
- Les modèles de mélanges pour l'analyse de la co-expression.
- Les méthodes de segmentation pour l'analyse longitudinale du génome.
- L'inférence statistique de réseaux de gènes.
