Le génome du melon Charentais déchiffré

 Cucumis melo présente une grande diversité de groupes horticoles, le melon cantaloup, connu en France sous le nom de Charentais, étant le type le plus cultivé. C’est à Charles VIII que l’on doit son introduction en France, à la fin du XVe siècle. En utilisant une combinaison de technologies de séquençage, l’équipe FloCad d’Abdelhafid Bendahmane, en interaction avec les laboratoires LRSV, CNRGV, GDEC et GAFL ont assemblé le génome du melon Charentais. L'intégration des données RNA-seq, MeDip-seq, ChIP-seq, et Hi-C a révélé une compartimentation étendue du génome du melon, ségrégeant l'hétérochromatine constitutive et l'euchromatine. Une analyse comparative et évolutive à l'échelle du génome entre les différents groupes botaniques de melon a identifié le génome du melon charentais comme étant de plus en plus divergent par rapport aux génomes Harukei-3 (reticulatus), Payzawat (inodorus), et HS (ssp. agrestis). Pour évaluer la paléohistoire des Cucurbitaceae, les chercheurs ont reconstruit le caryotype ancestral des Cucurbitaceae et l'ont comparé aux génomes séquencés d’autres cucurbitacées. Contrairement aux espèces qui ont subi un remaniement chromosomique massif, le melon a conservé la structure de son génome ancestral. Ces travaux, publiés dans iScience, fournissent des ressources génomiques complètes et de nouvelles perspectives sur la diversité des groupes horticoles de melon et l'évolution des cucurbitacées.

 Mise en Ligne le 08/03/2022