Thèses 2025 2026

Thèses soutenues fin 2025 début 2026

Michel HEIDECKER

Les longs ARN non-codants dans la régulation de l'épissage alternatif

Mots clés : interaction protéine-ARN, longs ARN non codants, régulation de l'épissage alternatif

Pour réguler leurs processus de développement, les plantes modifient de manière dynamique leur transcriptome, notamment par le biais de l'épissage alternatif (AS) des ARNm et de l'expression des ARN non-codants longs (lncRNA). Nous avons utilisé une analyse bioinformatique et un criblage par expression transitoire chez la plante modèle Arabidopsis thaliana afin d'identifier les lncRNA qui régulent l'AS. Nous avons caractérisé un lncRNA appelé ACHLYS, qui intervient dans le développement des racines. ACHLYS interagit directement avec le facteur d'épissage NSRa, dont la liaison est également plus fréquente dans les événements d'AS dépendants d'ACHLYS. Des taux élevés d'ACHLYS augmentent les concentrations de NSRa dans les « speckles » nucléaires, un condensat biomoléculaire impliqué dans l'épissage. Ces travaux ont permis de montrer que l'AS régule le développement eucaryote et que les ARN lnc sont des régulateurs courants des réseaux de régulation de l'AS.

Date soutenance : 6 octobre 2025

Co-encadrants : M. Crespi et J. Bazin

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Azhin MORTEZAZADEH

Rôle de la photorespiration dans les mouvements stomatiques chez Arabidopsis thaliana

Mots clés : Photorespiration, Stomates, Cellules de garde, Cellules du mésophylle, Échanges gazeux, Assimilation du carbone, Efficacité d’utilisation de l’eau, Amélioration des cultures

Au cours de ma thèse, j’ai étudié l’impact de l’activité du cycle photorespiratoire sur l’ouverture stomatique dépendante de la lumière, avec un intérêt particulier pour la nature potentiellement spécifique à certains types cellulaires de ce phénomène entre les cellules de garde et les cellules du mésophylle. Bien que les stomates soient depuis longtemps reconnus comme des acteurs clés de l’arbitrage entre l’absorption de CO₂ et la perte d’eau, le contrôle de la taille de l’ouverture stomatique est traditionnellement attribué à des réseaux de signalisation complexes répondant à des signaux environnementaux tels que la vapeur d’eau, la lumière, la température et le CO₂. Une conclusion majeure de ma thèse est que la photorespiration, longtemps considérée comme une voie métabolique coûteuse issue de l’activité oxygénase de la Rubisco, est peut-être un carrefour métabolique influençant les mouvements stomatiques en modulant les réseaux de signalisation et/ou le métabolisme végétal impliqué dans la production d’osmolytes et d’ATP.

Date soutenance : 9 décembre 2025

Encadrant : M. Jossier

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Tao CHEN

Analyses fonctionnelles de l'interaction entre l'acide salicylique et la thiorédoxine m1 chez Arabidopsis thaliana

Mots clés : Thiorédoxine, acide salicylique, régulation redox, immunité végétale

L'acide salicylique (SA) est une hormone clé régulant l'immunité et la croissance des plantes. La thiorédoxine m1 chloroplastique (TRX m1) a été précédemment identifiée comme protéine de liaison au SA, mais sa signification fonctionnelle restait inexplorée. Mes travaux de thèse ont étudié le mécanisme sous-jacent à cette interaction et son rôle. Des analyses biochimiques avec des protéines recombinantes purifiées révèlent que le SA inhibe à la fois la réduction de TRX m1 et son activité régulatrice envers ses enzymes cibles. Le résidu Lys41 du site actif s'est avéré essentiel pour la liaison du SA et ses effets. De plus, la quantification du SA et les niveaux d'expression de gènes liés aux ROS et au SA suggèrent que, chez Arabidopsis, les TRX m jouent un rôle dans la modulation des réponses de défense par la photopériode et en lien avec le stress oxydatif intracellulaire.

Date soutenance : 28 janvier 2026

Co-encadrants : E. Issakidis-Bourguet et G. Noctor

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24/07/2026