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Les transposons au cœur des réseaux cellulaires

Un atlas fonctionnel révèle la diversité des produits des transposons et leurs interactions avec les réseaux cellulaires chez Arabidopsis thaliana

Dans une étude publiée dans Nature Communications, des scientifiques de l’équipe QLAB à l’Institut des Sciences des Plantes de Paris-Saclay (IPS2) ont exploré à grande échelle les produits issus des transposons et leurs interactions avec les réseaux cellulaires chez Arabidopsis thaliana.

Les transposons sont des séquences d’ADN capables de se multiplier au sein des génomes grâce à des facteurs qu’ils codent eux-mêmes. La diversité de leurs ARNs et protéines, ainsi que leurs interactions avec la cellule hôte, restent cependant encore mal caractérisées. En combinant séquençage à longues et courtes lectures, analyses des réseaux de régulation, protéomique à haute profondeur, et prédictions structurales, les chercheurs ont établi un atlas fonctionnel des produits des transposons. Leurs résultats montrent que l’expression de ces éléments s’intègre aux réseaux de régulation de la cellule et dépend notamment de la méthylation de l’ADN et de l’action de facteurs de transcription. Plus d’une centaine de protéines issues de transposons ont également été identifiées avec un haut niveau de confiance. Les analyses structurales révèlent une importante diversité de structures et d’interactions potentielles avec les protéines de la plante. Elles mettent également en évidence des similarités entre certaines protéines de transposons et des protéines cellulaires, suggérant de nouveaux cas potentiels de domestication de transposons au cours de l’évolution.

Au final, ces travaux montrent que les transposons constituent des composants actifs des réseaux cellulaires et une source potentielle d’innovation génomique.

Cartographier l’activité des transposons, de l’ARN et des protéines aux réseaux cellulaires
Cartographier l’activité des transposons, de l’ARN et des protéines aux réseaux cellulaires

25/09/2026